Морфологические проблемы, связанные с влиянием ионизирующей радиации на различные органы и системы, разрабатывались в институте с 1929г., когда был организован отдел экспериментальной патологии, возглавляемый академиком РАМН Б.Н.Могильницким. В 1961 экспериментальный отдел был переименован в патоморфологический отдел с прозектурой.
Впервые в мире сотрудниками отдела под его руководством проводились экспериментальные исследования по изучению воздействия облучения на центральную и периферическую нервную системы. Серия работ была посвящена изучению влияния на организм комбинированных методов рентгенотерапии, а именно, применения различных раздражителей (соли металлов, продукты гидролиза белков, гормональные препараты и др.) в комбинации с рентгеновскими лучами. Это позволило уменьшить дозы облучения при применении неспецифических раздражителей, получая при этом такой же клинический эффект, что и при применении больших доз рентгеновского облучения. Следующие этапы научных исследований - изучение явления радиосенсибилизации, проявлений лучевой болезни, эффектов разных видов лучевой терапии на опухолевый процесс и окружающие опухоль здоровые ткани.
В 1972 г. патоморфологический отдел возглавил доктор мед. наук, профессор Г.А.Галил-Оглы. Проводимые научные исследования решали вопросы морфологической диагностики опухолей и опухолеподобных процессов в бронхах, легких, средостении, молочных железах, желудочно-кишечном тракте, лимфоидной ткани, мочеполовой системе и т.д. При этом в опухолях всех локализаций исследовались особенности терапевтического патоморфоза при различных видах лучевого, химиотерапевтического и комплексного лечения.
В связи с широким внедрением в клиническую практику методов современной таргетной химиотерапии злокачественных опухолей значительно возросла роль иммуногистохимического метода в определении чувствительности опухоли к определенным химиопрепаратам. Иммуногистохимический метод используется также для разработки критериев дифференциальной диагностики предраковых процессов и микрокарцином, ранних инвазивных раков в молочной и предстательной железах. Внедрены панели маркеров антител для определения первичной локализации опухоли при наличии метастазов без выявленного первичного очага. Проведена разработка и внедрение в практику критериев морфологической диагностики таких, сравнительно недавно выделенных в самостоятельные нозологические единицы, опухолей, как гастроинтестинальные стромальные опухоли (GIST) и опухоли из периваскулярных эпителиодных клеток (РЕС). В отделении изучаются молекулярно-биологические факторы прогноза, предсказывающие ответ различных вариантов рака шейки матки, эндометрия, молочной железы и полости рта на те или иные виды комбинированного лечения.
